У яда горький вкус и кислая реакция (рН-4,5-5,5).

Содержание сухого вещества в яде варьирует от 30 до 45%. Помимо воды в летучей фракции яда установлены: n-амиловый изоамиловый и этиловый ацетаты. Высушенный пчелиный яд представляет собой многокомпонентную смесь из неорганических и органических веществ.

Зольность пчелиного яда (минеральные вещества, остающиеся после сжигания яда при температуре 500-600ºС) составляет 3-4% высушенного яда. В золе установлены: фосфор, кальций, магний и медь. В минимальных количествах обнаружено присутствие хлоридов. Наиболее распространенные элементы живых организмов – натрий и калий – не обнаружены в пчелином яде. Между низкомолекулярными органическими соединениями имеются биогенные амины: гистамин (от 0,34 до 0,57%), допамин и норадреналин.

Большинство исследователей установили в пчелином яде присутствие сахаров. Действительно, в каждом товарном образце пчелиного яда содержится до 2 до 6% сахаров. Однако чистый пчелиный яд, полученный с помощью коллектора, имеющего плотную нейлоновую ткань, предохраняющую яд от загрязнения пыльцой, нектаром и частицами пчелиных тел, не содержит сахаров.

Жироподобные вещества имеются в яде в низких концентрациях – 1-3%, в низкой концентрации обнаружены и свободные аминокислоты – около 1%. Основной частью сухого вещества – около 80% – являются белки и пептиды. Они представляют собой наиболее активные биохимические и фармакологические компоненты пчелиного яда.

До настоящего времени выделены и исследованы в различной степени следующие белки и пептиды: энзимы – гиалуронидаза, фосфолипаза А, лизофосфолипаза (фосфолипаза В), кислая фосфомоноэстераза, альфаглюкозидаза; пептиды – мелиттин, апамин, MCD-пептид (пептид 401), протеазный ингибитор, адолапин, мелиттин F, секапин и терциапин.